3月21日に発生した函館大火からの復興をめざし、全国からの義援金の一部を資本に「財団法人函館共愛会」が創設されました。市内の慰霊堂は、共愛会が遭難死者の霊を追悼するために1937年に建立した堂で、その後函館市に引き継いでいます。

翌1935年から児童保護事業、職業紹介所開設、被災者のための住宅の建設・貸与、簡易宿泊所開設、授産講習所での授産並びに講習指導などに尽力。1937年には共愛会館（新川町）を開設し、法人事務所と複数の施設機能を移転しました。

戦果の中、運営する託児所が大破し復旧工事を行うなどの記録が当時の資料に残っています。終戦後は米国進駐軍が共愛会館に駐屯。1952年には社会福祉法人となり、翌1953年には運営する駒止保育園が優良施設として厚生大臣より表彰されました。

1954年には昭和天皇と皇后両陛下が行幸啓され、中央保育園を視察。共愛会館でご休憩されました。同年「洞爺丸台風」と称される海難事故が発生、共愛会一体となって救護等を行います。1956年には共愛会病院を開設。託児所が保育園となり、園の認可・開設も続いた時代でした。

愛泉寮、みなみかやべ荘、知内しおさい園と、老人福祉事業が拡大していきます。1983年には共愛会館が46年の歴史に幕を下ろし、本部が中島町へ移転。1999年には経営不振により共愛会病院を一時休止。（2000年に特定医療法人徳洲会の支援を受け再開）

児童福祉と老人福祉に注力する中で、2019年、共愛会病院を医療法人徳洲会に事業譲渡し経営を分離しました。2024年で法人設立から90年となり、新たな教育・保育計画、法人理念のもと「ともに笑顔で」いられる社会の形成に力を尽くします。